Nacido en la Habana el 4 de octubre de 1962. A los nueve años se trasladó con sus padres a los Estados Unidos, donde desarrolló su carrera artística al ingresar a la universidad de Miami, siendo uno de los primeros estudiantes en obtener la licenciatura y maestría en interpretación vocal de jazz.

A finales de la década de los 80 conoció a Emilio Estefan, quien lo convirtió en uno de los cantantes más importantes del coro de Gloria Estefan, y a su vez, coautor de algunas de sus mejores canciones.

Trabajo con Emilio Estefan durante cinco años, antes de lanzamientos de su primer álbum que llevó su mismo nombre, y el que rápidamente le concedió la fama internacional que aun posee, al vender en su primer año como solista cerca de 6 millones de copias alrededor del mundo.

En 1990 cambió su nombre por el de Jon.

En 1995 Walt Disney Productions incluyó un tema de Jon Secada en la banda sonora de “Pocahontas” fue “If I Never Know You”, interpretada por Secada y Shanice Wilson y compuesta por Alan meneen y Stephen Schwartz.

El 28 de Febrero de 1996 recogió en Los Ángeles su segundo Premio Grammy a la Mejor Interpretación Latina de Pop. Jon declaró en numerosas ocasiones que toda esa formación le ayudó después en su trabajo con otros músicos, fueran de la nacionalidad que fueran. Y también demostró en numerosas ocasiones que valora la formación musical para la formación humana. De hecho, en 1996 estableció las Becas de Música “Jon Secada” en la Universidad de Miami en la que estudió. Y también comenzó su trabajo de colaboración con la campaña “Manteniendo la música en las escuelas” que patrocina la Academia Nacional de Artes y Ciencias de la Grabación (NARAS).

Contrajo matrimonio con su novia Mari Tere, con quien se casó el 22 de febrero de 1997. Actualmente vive en Miami con su esposa y su hija Micaela Nina.